หน่วยงานที่จะเข้ามารับหน้าที่ดูแลภารกิจการกวาดล้างยาเสพติด แทนที้เจ้าหน้าที่ตำรวจ คือ Drugs Enforcement Agency ของประเทศฟิลิปปินส์
สำนักงานตำรวจแห่งประเทศฟิลิปปินส์เผยว่า คำสั่งของดูแตร์เต้ มีผลให้เจ้าหน้าที่ตำรวจกว่า 1,200 นาย ในกรุงมนิลาถูกย้ายไปยังหน่วยอื่น ซึ่งไม่ใช่ครั้งแรกที่ดูแตร์เต้สั่งให้เลิกใช้กำลังตำรวจในสงครามยาเสพติด
สำหรับครั้งแรกคือเมื่อช่วงต้นปีที่ผ่นามา ภายหลังปฏิบัติการณ์กวาดล้างยาเสพติดของตำรวจทำให้นักธุรกิจชาวเกาหลีใต้ต้องเสียชีวิต หลังจากนั่นไม่นาน ดูแตร์เต้ ก็เปลี่ยนใจ กลับมาใช้ตำรวจเป็นกำลังหลักอีกครั้ง
แต่ในช่วงเดือนที่ผ่านมาแรงกดดันต่อต้านนโยบายกวาดล้างยาเสพติดเพิ่มขึ้นมาก จนทำให้คะแนนนิยมของดูแตร์เต้ตกลงถึงจุดต่ำสุดตั้งแต่เข้ามาดำรงค์ตำแหน่งเมื่อปีที่แล้ว
ตลอดระยะเวลากว่า 1 ปีที่ผ่านมา สงครามกวาดล้างยาเสพของดูแตร์เต้ ทำให้มีผู้เสียชีวิตแล้วไม่ต่ำกว่า 3,850 คน