สัตว์ 3 ชนิดหลักๆ ที่เป็นที่แน่ชัดแล้วว่าเคยหายไปจากสวนสัตว์หาดใหญ่ คือ เก้งเผือกพระราขทาน หากย้อนไทม์ไลน์เก้งเผือกสายพันธุ์พระราชทานจะพบว่า มีด้วยกัน 3 รุ่น รุ่นที่ 1 คือคุณเทียน ตายแล้ว รุ่นที่ 2 คือ คุณมูมู่ ยังมีชีวิตอยู่ และรุ่นที่ 3 คือคุณภูมิ หายไปเมื่อ 19 ก.พ.2563 จากส่วนจัดแสดง ต่อมาเดือน เม.ย. พบซากกระดูกเก้งในส่วนจัดแสดง พ.ค.2563 พิสูจน์แล้วว่าเป็นกระดูกเก้งธรรมดาที่งูเหลือมกินแล้วคายไว้
เปิดรายละเอียด “เก้งเผือกพระราชทาน” ชนวนสังหาร ผอ.องค์การสวนสัตว์ฯ
ด่วน! ยิงดับ 'ผอ.องค์การสวนสัตว์' อุกอาจ ขณะเข้าตรวจสอบปมลูกเก้งเผือกหาย ที่สงขลา เปิดชนวนร้อน
22 ก.ย. 2563 เก้งเผือกตัวที่ 2 คุณภาค หายไป และพบว่าถูกงูเหลือมกินเนื่องจากผ่าท้องงูเหลือมแล้วพบซากเก้งเผือก
นั่นหมายความว่า เก้งเผือกพระราชทานที่หายไปจนถึงปัจจุบัน คือ คุณภูมิ
ต่อมาคือกรณี “นอแรด” หายไป
25 ก.พ.2555 แรดขาวของสวนสัตว์สงขลาได้ตายลง 1 ตัว ต่อมาทางสวนสัตว์สงขลาได้ตัดนอแรด 2 อันคือ นอแหลม ซึ่งมีลักษณะยาวโผล่ออกมาด้านนอก และ นอทู่ ซึ่งมีลักษณะซ่อนอยู่ด้านในต้องทำการผ่าออกมา และนำไปเก็บไว้ที่คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ วิทยาเขตหาดใหญ่
11 มิ.ย.2561 สวนสัตว์สงขลา ติดตามนอแรด แต่พบว่ามีเจ้าหน้าที่มาเบิกไปแล้วจากมหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ วิทยาเขตหาดใหญ่ ตั้งแต่วันที่ 21 มี.ค.2556 ก่อนที่จะมีการตรวจสอบแล้วพบว่ามีการทำเอกสารเท็จ ทั้งที่เบิกนอแรดไปเพียง 1 อัน
3 ก.ค.2561 สวนสัตว์สงขลา แจ้งความ สภ.เมืองสงขลา ส่งต่อคดีให้ สภ.คอหงส์ ทราบต่อมาภายหลังมีเจ้าหน้าที่เบิกนอแรดไป 2 คน คนหนึ่งนำนอแรดทู่ไปและได้ติดตามกลับคืนมาได้ ส่วนอีกคนนำนอแรดแหลมไปและเสียชีวิตลงจึงไม่สามารถติดตามคืนมาได้ โดยทั้งสองคนถูกดำเนินการทางวินัยไล่ออก
ต่อมาเป็น นกแก้วมาร์คอ หายไป 13 ตัว และติดตามกลับมาได้ 2 ตัว โดยพบว่ามีการนำไปโพสต์ขาย
ด่วนมาก!! สัตวแพทย์ มือยิง ผอ.องค์การสวนสัตว์ ยิงตัวตายหนีผิดแล้ว เผยก่อเหตุขณะถูกสอบสวน
เปิดสัมภาษณ์สุดท้าย 'ผอ.องค์การสวนสัตว์' กังวลเก้งเผือกหาย หาหลักฐานไม่ได้
เปิดชนวนสลด ดับ 'ผอ.สุริยา' ย้อนรอยลูกเก้งเผือกพระราชทานหาย สั่งย้ายบิ๊กสวนสัตว์สงขลา
เปิดความต้องการ “เก้งเผือก” ในตลาดมืด
สวนสัตว์สงขลา เคยมีสัตว์ป่าหายหลายครั้ง พบมีมูลค่าสูง