ผลการตรวจสอบสารตกค้างในผัก และผลไม้ ปี 2560 ของกรมวิทยาศาสตร์ การแพทย์ พบว่า ส้ม เป็นผลไม้ที่มีสารตกค้างจากยาฆ่าแมลงมากที่สุด โดยเฉพาะสาร ไซเปอร์เมทริน (Cypermethrin) ซึ่งเป็นสารที่ไม่ดูดซึมซึ่งพบได้ในส้มมากกว่าผลไม้ชนิดอื่น
ผลการตรวจระบุว่า สารตกค้างมักติดอยู่บริเวณผิวเปลือกส้ม เนื่องจากเปลือกส้มจะมีน้ำมันจำนวนมาก ทำให้สามารถดูดจับสารเคมีเอาไว้ ขณะเดียวกัน ผลตรวจ ยังพบว่า ช่วงตรุษจีน เป็นช่วงที่ตรวจพบสารเคมีในผลไม้ มากกว่าช่วงอื่น เชื่อว่าเป็นผลมาจาก เกษตรกรผู้ปลูกส้มต้องการเร่งเก็บเกี่ยวผลผลิตเพื่อให้ทันกับความต้องการของประชาชน หากประชาชนบริโภคโดยไม่ระมัดระวัง อาจมีความเสี่ยงต่อสุขภาพ
กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ แนะนำวิธีการบริโภคส้ม ให้ปลอดจากสารพิษ ผู้บริโภคควรล้างส้มด้วยการถูที่เปลือก และปล่อยน้ำสะอาดไหลผ่านประมาณ 5-10 นาทีก่อนรับประทานซึ่งจะช่วยลดสารตกค้างได้ร้อยละ 25-65 หากล้างส้มโดยใช้ผงฟู หรือน้ำส้มสายชูในการล้างจะช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการลดปริมาณสารตกค้างในเปลือกส้ม ส่วนผัก และ ผลไม้อื่นๆ ส่วนใหญ่ปีนี้ มีปริมาณสารเคมีตกค้าง น้อยกว่าปีที่ผ่านมา ซึ่งวิธีป้องกันที่ดีที่สุดคือการล้างให้สะอาดก่อนบริโภคทุกครั้ง