ตั้งแต่ช่วงเช้าวันที่ 24 ก.ค. 68 ชุดควบคุมกรมทหารพรานที่ 12 และด่านศุลกากรอรัญประเทศ จังหวัดสระแก้ว ไขกุญแจเปิดประตูด่านคลองลึกในเวลา 08.00 น. ตามปกติ แต่หลังจากนั้นไม่นาน ผ่านไปเพียง 40 นาทีเท่านั้น หน่วยงานความมั่นคงของไทยได้ปิดประตูด่านอีกครั้ง ตามคำสั่งของกองทัพภาคที่ 1 หลังเกิดการปะทะระหว่างไทย-กัมพูชา ในช่วงเช้าวันเดียวกัน
ในขณะนั้น เจ้าหน้าที่ของไทยพบว่า มีคนไทยที่ทำงานในปอยเปต ได้เก็บกระเป๋าและข้าวของเครื่องใช้มายืนรอกันอยู่ที่หน้าประตูด่านปอยเปตฝั่งประเทศกัมพูชาเป็นจำนวนมาก
ก่อนที่ผู้นำหน่วยของไทย จะรายงานผู้บังคับบัญชาตามลำดับชั้น
กระทั่งฝ่ายไทยได้เปิดประตูด่านอีกครั้งในเวลา 12.00 น. เพื่อให้คนไทยเดินทางกลับเข้ามาในฝั่งประเทศไทย โดยกำหนดว่าทั้ง 2 ฝ่ายจะปิดประตูด่านในเวลาปกติ คือ 16.00 น. พร้อมกัน แต่ในขณะนั้น คนไทยได้ทยอยเดินทางข้ามแดนกลับเข้าไทยเป็นจำนวนมาก
ทำให้ พันเอก เมธี คำเต็ม ผู้บังคับการชุดควบคุมกรมทหารพรานที่ 12 เดินข้ามสะพานมิตรภาพไทย-กัมพูชา (คลองกั้นแดน) เข้าไปพูดคุยกับหน่วยงานด้านความมั่นคงของกัมพูชา ก่อนจะตกลงร่วมกันว่า จะขยายเวลาปิดประตูด่านจากเดิม 16.00 น. ไปเป็น 18.00 น.
โดยตลอดทั้งวันนี้ ไทยเปิดประตูด่านคลองลึก มีคนไทยข้ามแดนกลับเข้ามาทั้งสิ้น 1,995 คนเป็นชาย 978 คน หญิง 1,017 คน ส่วนคนกัมพูชาข้ามแดนออกไปทั้งสิ้น 316 คน