กระทรวงการต่างประเทศของไต้หวันไม่ยอมรับแถลงการณ์ร่วมที่จัดทำขึ้นภายหลังการพบปะระหว่าง อนุทิน ชาญวีรกูล นายกรัฐมนตรีของไทย และสี จิ้นผิง ผู้นำประเทศจีน โดยระบุว่าแถลงการณ์ดังกล่าวเป็นการสนับสนุนข้อกล่าวอ้างของรัฐบาลจีนที่ว่าไต้หวันเป็นส่วนหนึ่งของจีน
ลิน เจียหลง รัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศไต้หวัน กล่าวว่า ไต้หวันคัดค้านการที่จีนใช้วาระการประชุมระดับนานาชาติในการบ่อนทำลายสถานะในเวทีโลกของไต้หวัน พร้อมทั้งแสดงความเสียใจที่ประเทศไทยยอมรับตำแหน่งและข้อยึดถือของจีน
และเมื่อถูกถามว่าแถลงการณ์นี้จะส่งผลกระทบต่อนโยบายฟรีวีซาระหว่างไต้หวันและไทยหรือไม่ รัฐมนตรีต่างประเทศไต้หวัน ชี้แจงว่า ไต้หวันกำหนดนโยบายวีซาโดยยึดหลักความต่างตอบแทนและการปฏิบัติต่างฝ่ายอย่างเท่าเทียม พร้อมเน้นย้ำว่าทั้งสองประเทศยังคงมีความสัมพันธ์ทางเศรษฐกิจที่ใกล้ชิดและการแลกเปลี่ยนระหว่างประชาชนอย่างสม่ำเสมอ
นอกจากนี้ แถลงการณ์ร่วมดังกล่าวยังระบุว่า ประเทศไทยสนับสนุนนโยบาย "หนึ่งประเทศ สองระบบ" ของรัฐบาลปักกิ่ง ซึ่งทางกระทรวงการต่างประเทศไต้หวันระบุว่า ถ้อยคำดังกล่าวว่าไม่เป็นความจริงและละเมิดอธิปไตยของไต้หวัน
กระทรวงการต่างประเทศไต้หวัน ย้ำว่า ไต้หวันเป็นประเทศที่มีอธิปไตยและเป็นอิสระ โดยไต้หวันและจีนไม่ได้เป็นส่วนหนึ่งของกันและกัน พร้อมกล่าวหา จีนว่าใช้แถลงการณ์ร่วมกับประเทศต่างๆ ในการแพร่เผยแพร่ข้อมูลเท็จและพยายามเปลี่ยนแปลงสถานะเดิมของสองฝั่งช่องแคบไต้หวัน
ไต้หวัน จึงเรียกร้องให้ประเทศไทยให้ความสำคัญกับความสัมพันธ์อันยาวนานของทั้งสองประเทศ และหยุดสนับสนุนแรงกดดันไต้หวันของจีน และยังเตือนว่าพฤติกรรมขยายอิทธิพลของจีนเป็นภัยคุกคามต่อสันติภาพในภูมิภาค และอาจส่งผลกระทบในท้ายที่สุดต่อประเทศที่ยอมปฏิบัติตามข้อเรียกร้องของจีน