เจ้าหน้าที่การบินของอียิปต์ ออกมายืนยันว่า เครื่องบินโดยสารอียิปต์แอร์ เที่ยวบิน MS804 ไม่ได้ทำการหักเลี้ยวแบบผิดปกติ หรือลดเพดานการบินก่อนจะหายไปจากจอเรดาร์ โดยเครื่องบินทำการบินอยู่ที่ระดับความสูงปกติ 37,000 ฟุต และไม่พบความผิดปกติใดๆ เกิดขึ้นกับเครื่องบิน ขณะที่เครื่องบินเข้าสู่น่านฟ้าของอียิปต์ ก่อนที่เครื่องจะหายไป ซึ่งข้อมูลนี้ขัดแย้งกับข้อมูลที่กระทรวงกลาโหมกรีซออกมาเผยก่อนหน้านี้ว่า เครื่องบินลำดังกล่าวได้เลี้ยวซ้ายหักศอก 90 องศา และหักเลี้ยวขวา 360 องศา ก่อนจะลดระดับเพดานการบินอย่างรวดเร็ว และหายไปจากจอเรดาร์
อย่างไรก็ตาม ตัวแทนครอบครัวผู้โดยสารชาวฝรั่งเศสออกมาระบุว่า ไม่เชื่อใจกระบวนการทำงานของทีมสอบสวนอียิปต์ และต้องการให้ทีมสอบสวนจากฝรั่งเศสเข้าไปมีส่วนเกี่ยวข้องทั้งในปฏิบัติการค้นหาและพิสูจน์อัตลักษณ์มากขึ้น
ส่วนความคืบหน้าปฏิบัติการค้นหาซากเครื่องบิน เจ้าหน้าที่ยังคงเดินหน้าค้นหากล่องบันทึกข้อมูลการบินหรือกล่องดำต่อไป เนื่องจากเครื่องส่งสัญญาณระบุตำแหน่งจากกล่องดำจะมีอายุการทำงานเพียง 30 วันเท่านั้น ขณะที่เจ้าหน้าที่สืบสวนเริ่มทำการเก็บตัวอย่างดีเอ็นเอจากครอบครัวของผู้โดยสารที่อยู่บนเครื่อง เพื่อใช้ในกระบวนการพิสูจน์อัตลักษณ์ต่อไป