สมเด็จพระสันตะปาปาฟรานซิลเสด็จออกจากเกาะตาโกลบาน ซึ่งเป็นพื้นที่ที่ถูกพายุไต้ฝุ่นไห่เยี่ยนพัดถล่มเมื่อช่วงปลายปี 2556 ก่อนกำหนดการ 4 ชั่วโมง เนื่องจากพายุโซนร้อน "เมขลา" กำลังเคลื่อนตัวมุ่งหน้ามายังบริเวณดังกล่าว
ผลกระทบจากพายุโซนร้อน "เมขลา" ซึ่งเคลื่อนที่ด้วยความเร็ว 100 กิโลเมตรต่อชั่วโม ทำให้เกิดคลื่นสูง จนเรือข้ามฟากที่ไปยังจังหวัดเลย์เต ต้องงดให้บริการชั่วคราว ทำให้นักท่องเที่ยวนับพันคนต้องพลาดโอกาสที่จะได้ต้อนรับสมเด็จพระสันตะปาปาฟรานซิส
รัฐบาลฟิลิปปินส์ได้ประกาศให้ช่วงเวลาที่สมเด็จพระสันตะปาปาฟรานซิสเสด็จเยือนเป็นวันหยุดราชการ รวมทั้งหมด 3 วัน ซึ่งในวันพรุ่งนี้ซึ่งเป็นวันสุดท้าย สมเด็จพระสันตะปาปาฟรานซิส จะประกอบพิธีมิสซาที่สวนสาธารณะริซัล พาร์ค ในกรุงมนิลา