ตามที่มีการอภิปรายในประเด็นเกี่ยวกับกรณีคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ ( ป.ป.ช. ) มีมติให้เพิกถอนโฉนดที่ดินเลขที่ 3466 และ 8564 ตำบลอิสาณ อ.เมืองบุรีรัมย์ จ.บุรีรัมย์ เมื่อปี 2554 นั้น กรมที่ดินได้ตั้งคณะกรรมการสอบสวนตามมาตรา 61 แห่งประมวลกฎหมายที่ดิน และมีความเห็นไม่เพิกถอนโฉนดที่ดินเนื่องจากการรถไฟฯ ไม่มีแผนที่แนบท้าย พ.ร.ฏ.จัดซื้อที่ดินฯ พ.ศ. 2464 มาแสดง
กรมที่ดิน ได้หารือสำนักงานอัยการสูงสุด ซึ่งสำนักงานอัยการสูงสุดพิจารณาเห็นว่า การที่อธิบดีกรมที่ดินไม่เพิกถอนโฉนดที่ดิน ไม่ตัดสิทธิการรถไฟฯ จะฟ้องหรือร้องต่อศาลเพื่อขอให้เพิกถอนโฉนดที่ดินทั้งสองแปลง และการดำเนินการไม่ขัดต่อมติของคณะกรรมการ ป.ป.ช. ส่วนการพิจารณาของอธิบดีกรมที่ดินเป็นไปตามหลักเกณฑ์ที่กฎหมายกำหนดไม่เกี่ยวข้องกัน โดยให้กรมที่ดินแจ้งการรถไฟฯ เพื่อทราบผลการพิจารณา ไม่เพิกถอนโฉนดที่ดิน และแจ้งให้การรถไฟฯ ไปฟ้องต่อศาลเพื่อขอให้เพิกถอนโฉนดที่ดิน ซึ่งการรถไฟฯ ไม่ได้ฟ้องต่อศาลให้เพิกถอนโฉนดที่ดินทั้งสองแปลงแต่อย่างใด แต่ได้ฟ้องกรมที่ดินและอธิบดีกรมที่ดินต่อศาลปกครองกลางเมื่อปี พ.ศ. 2566 เพื่อขอให้อธิบดีกรมที่ดินเพิกถอนโฉนดที่ดินจำนวน 995 แปลง ในพื้นที่เขากระโดง จังหวัดบุรีรัมย์
โดยปัจจุบันอธิบดีกรมที่ดินได้เห็นชอบกับความเห็นของคณะกรรมการสอบสวนฯ ตามมาตรา 61 แห่งประมวลกฎหมายที่ดิน ที่มีความเห็นไม่เพิกถอนหนังสือแสดงสิทธิในที่ดินในพื้นที่พิพาทเขากระโดงและปัจจุบันอยู่ระหว่างการรถไฟฯ ใช้สิทธิฟ้องคดีต่อศาลปกครองต่อไป ทั้งนี้ หากการรถไฟฯ อ้างว่าตนเป็นเจ้าของที่ดินตั้งแต่ปี พ.ศ. 2464 จริง เหตุใดจึงปล่อยให้ประชาชนครอบครองทำประโยชน์โดยประชาชน ได้แจ้ง ส.ค.1 ไว้ด้วยตั้งแต่ปี พ.ศ. 2497 และมีการออกหนังสือแสดงสิทธิในที่ดินเรื่อยมาตั้งแต่ปี พ.ศ. 2509 โดยการรถไฟก็ได้มารับรองแนวเขตและยืนยันว่าที่ดินไม่ใช่ที่ดินของการรถไฟ
สำหรับกรณีที่ดินอัลไพน์ นั้น ปัจจุบันรองปลัดกระทรวงมหาดไทย หัวหน้ากลุ่มภารกิจด้านกิจการความมั่นคงภายใน เห็นชอบให้เพิกถอนคำสั่งไม่เพิกถอนรายการจดทะเบียนโอนมรดกที่ไม่ชอบด้วยกฎหมายแล้ว ปัจจุบันอยู่ระหว่างสำนักงานที่ดินจังหวัดปทุมธานี สาขาคลองหลวง ดำเนินการเรียกโฉนดที่ดินจากผู้มีส่วนได้เสียเพื่อดำเนินการจดแจ้งการเพิกถอนโฉนดที่ดินและรายการจดทะเบียนสิทธิและนิติกรรมแล้ว ส่วนประเด็นค่าเสียหายจากการเพิกถอนโฉนดที่ดิน เป็นสิทธิของผู้มีส่วนได้เสียที่สามารถฟ้องเรียกค่าเสียหายจากกรมที่ดินซึ่งเป็นหน่วยงานที่ออกโฉนดที่ดินหรือจดทะเบียนสิทธิและนิติกรรมที่ไม่ชอบด้วยกฎหมายได้ การดำเนินการทั้งกรณีที่ดินเขากระโดงและที่ดินอัลไพน์ กรมที่ดินดำเนินการตามระเบียบ กฎหมาย และอยู่ในกระบวนการของทางราชการแล้ว