เมื่อวันที่ (28 ส.ค.62) ผู้สื่อข่าวรายงานว่า ประเด็นที่เกิดขึ้น นายกวินทร์เกียรติ นนธ์พละ รองเลขาธิการสำนักงานคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน ซึ่งเป็นผู้เซ็นรับรอง อนุมัติให้ นายศุภกิจ จิตคล่องทรัพย์ ผู้อำนวยการโรงเรียนกรุงเทพคริสเตียนวิทยาลัย กลับมาปฏิบัติหน้าที่ เป็นผู้อำนวยการโรงเรียนกรุงเทพคริสเตียนเหมือนเดิม หลังจากถูกสภาคริสตจักร ตั้งคณะกรรมการสอบข้อเท็จจริง และถูกสั่งให้ย้ายไปปฏิบัติหน้าที่ สำนักงานพันธกิจการศึกษา จ.เชียงใหม่ กรณีการซื้อขายที่ดินและโรงเรียนใน จ.บึงกาฬ และประเด็นอื่นๆ 6 ประเด็น ชี้แจงว่า การตรวจสอบเอกสารการพักงานของอดีต ผอ.รร.กรุงเทพคริสเตียน ที่สภาคริสตจักรออก ไม่ถูกต้องตามกฎกระทรวงศึกษา เรื่องการพักงาน คือ ในหนังสือสั่งให้อดีต ผอ.พักงาน 30 วัน แต่ข้อเท็จจริงสามารถสั่งพักงานได้เพียง 7 วันเท่านั้น
ทั้งนี้แม้ ทางสช.จะมีคำสั่งให้ อดีต ผอ.ย้ายกลับมา แต่ไม่สามารถทำได้ เพราะก่อนหน้านี้สภาคริสตจักร แก้ไขคำสั่งพักงาน เป็นคำสั่งย้ายตำแหน่ง ซึ่งเป็นเรื่องระเบียบภายในโรงเรียน ทางสช.จึงไม่สามารถเข้าไปก้าวล่วงได้ แต่หากพบว่า การย้าย ส่งผลให้การเรียนการสอน ต่อเด็กนักเรียน และครู ในฐานะที่เป็นหน่วยงานกำกับดูแลโดยตรง สามารถเข้ามาตรวจสอบ และแก้ไขได้ ซึ่งกรณีที่เกิดขึ้น มีการเรียกร้องขอให้หน่วยงานกลาง เข้ามาร่วมตรวจสอบข้อเท็จจริง กับสภาคริสตจักร ที่อ้างว่าพบการทำผิดระเบียบจนมีคำสั่งย้าย เพื่อความโปร่งใส
ล่าสุด สช. มีคำสั่งตั้งคณะกรรมการตรวจสอบข้อเท็จจริง เพื่อแก้ไขปัญหาความขัดแย้งที่้เกิดขึ้น ซึ่งคณะกรรมการมี 6 คน ทั้ง 6 คน เป็นบุุคคลตำแหน่งต่าง ๆ ใน สช. เช่น รองเลขาธิการคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน ผู้อำนวยการโรงเรียนสามัญศึกษา หัวหน้ากลุ่มนิติกร และหัวหน้าส่งเสริมสถานศึกษา เป็นต้น ส่วน ประเด็นการเรียกร้องให้ ให้ สช.เข้าไปเป็นคณะกรรมการในสภาคริสตจักร เพื่อคานอำนาจ และร่วมตรวจสอบ กรณีต่าง ๆ ที่กลุ่มผู้ร้องอ้างกรรมการชุดปัจจุบันในสภาคริสตจักรเป็นกลุ่มคนที่มีผลประโยชน์ร่วมกัน เป็นเรื่องที่ สช.ต้องคุยกับสภาคริสตจักร โดยให้ทางสภาคริสตจักร ร้องขอมา ซึ่งทางสช.จะนัดหารือเร็ว ๆ นี้