นักวิจัยในจีนวิเคราะห์ดีเอ็นเอของแพนด้าแดงในธรรมชาติ 65 ตัว จนพบหลักฐานว่าจริงๆ แล้ว แพนด้าแดงในจีนและแพนด้าแดงในเทือกเขาหิมาลัยไม่ได้เป็นชนิดย่อยในสายพันธุ์เดียวกัน แต่เป็นคนละสายพันธุ์กันเลย
ที่ผ่านมา นักวิทยาศาสตร์สงสัยมานานแล้วว่าแพนด้าแดงที่พบในสองแห่งนี้อาจเป็นคนละสายพันธุ์กัน เนื่องจากลักษณะทางกายภาพที่แตกต่างกัน แต่ยังขาดหลักฐานทางพันธุกรรม
แพนด้าแดงจีนจะมีขนสีแดงกว่าและมีลายที่หางเป็นวงชัดเจน ขณะที่แพนด้าแดงหิมาลัย หน้าจะขาวกว่า
นายหู อี้ปั๋ว หัวหน้าทีมวิจัยของสถาบันวิทยาศาสตร์จีนในกรุงปักกิ่ง บอกว่า แพนด้าแดงหิมาลัยต้องการการคุ้มครองเร่งด่วนมากกว่า เนื่องจากมีความหลากหลายทางพันธุกรรมและจำนวนประชากรน้อยกว่า
แรกเริ่ม แพนด้าแดงถูกเข้าใจว่าเป็นญาติกับแรคคูน เพราะลักษณะหลายๆ อย่างที่คล้ายกัน เช่น หางที่มีลายวงแหวน ก่อนจะถูกเข้าใจว่าเป็นญาติกับหมี
แต่ปัจจุบัน เป็นที่เข้าใจแล้วว่าแพนด้าแดงเป็นสัตว์ที่อยู่ในวงศ์ของตัวเอง และเป็นหนึ่งในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่มีความโดดเด่นทางวิวัฒนาการมากที่สุดและใกล้สูญพันธุ์มากที่สุดชนิดหนึ่ง
แพนด้าแดงมีถิ่นอาศัยอยู่ในป่าตามหุบเขาของจีน อินเดีย เนปาล ภูฏาน และเมียนมาร์ โดยพวกมันมีจำนวนเหลืออยู่ไม่กี่พันตัวและลดลงทุกวันเนื่องจากการสูญเสียถิ่นที่อยู่ในธรรมชาติ การล่า และการผสมพันธ์ระหว่างสายเลือดเดียวกัน