รองอธิบดีกรมควบคุมมลพิษ นายสุวรรณ นันทศรุต ชี้แจงเอกสาร ลงวันที่ 12 ตุลาคม 2559 ที่กรมโรงงานอุตสาหกรรม ใช้อ้างกับชาวตำบลน้ำพุ อำเภอจเมือง จังหวัดราชบุรี เมื่อวันที่ 8 พฤศจิกายน ที่ผ่านมาว่า ไม่สามารถสั่งปิดโรงงานรีไซเคิล บริษัท แวกซ์ กาเบจ รีไซเคิล เซ็นเตอร์ได้ เพราะในเอกสาร กรมควบคุมมลพิษ ไม่ชี้ชัดว่า การปนเปื้อนของเสียอันตราย มีที่มาจากโรงงาน ซึ่งขัดแย้งกับเอกสารของกรมควบคุมมลพิษเอง เมื่อ 4 สิงหาคม 2559 ที่ยืนยันชัดว่า ของเสียอันตรายที่มีทั้งสารอินทรีย์ระเหยง่าย และโลหะหนัก มีทิศทางการไหลมาจากแหล่งน้ำในโรงงาน
กรมควบคุมมลพิษ จึงโต้แย้งว่า กรมโรงานอุตสาหกรรม ตีความเอกสารผิด เพราะเอกสารวันที่ 12 ตุลาคม ยังคงยืนยันว่า การปนเปื้อน มีที่มาจากโรงงาน เพียงแต่ระบุไม่ได้ว่า มาจากส่วนไหนของโรงงานแห่งนี้ ดังนั้นจึงเตรียมส่งเอกสารใหม่ให้กรมโรงงานฯ ทันที เพื่อไม่ให้เกิดความเข้าใจผิด
กรมควบคุมมลพิษ ยืนยันว่า ไม่สามารถดำเนินการตามกฎหมายกับโรงงานแวกซ์ กาเบจ รีไซเคิล เซ็นเตอร์ได้ เพราะหน้าที่บังคับใช้กฎหมาย เป็นของกรมโรงงานอุตสาหกรรม แต่ยืนยันว่าเข้าตรวจสอบตามคำเรียกร้องทุกครั้ง และส่งผลการตรวจสอบให้ทุกหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง รวมทั้งกรมโรงงานฯด้วย
ส่วนกรมโรงงานอุตสาหกรรม หลังจากลงพื้นที่ตรวจโรงงาน วันที่ 8 พฤศจิกายน และพบหลุมฝังกลบไม่ได้มาตรฐาน มีน้ำรั่วซึม เมื่อเกิดฝนตกจึงชะน้ำออกสู่สิ่งแวดล้อมภายนอก จึงสั่งปิดการดำเนินการโรงงานแวกซ์ กาเบจ รีไซเคิล เซ็นเตอร์ชั่วคราว เป็นเวลา 30 วัน ตั้งแต่วันที่ 10 พฤศจิกายน