ประเด็นการแต่งตั้งเจ้าอาวาสวัดพระธรรมกาย ยังคงต้องจับตาดูกันต่อไปว่าจะเป็นพระรูปไหน หลังพระเทพรัตนสุธี เจ้าคณะจังหวัดปทุมธานี หารือกับ พ.ต.ท.พงศ์พร พราหมณ์เสน่ห์ ผู้อำนวยการสำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ โดยมีความเห็นว่ายังไม่แต่งตั้งพระนอกเข้ามารับหน้าที่เจ้าอาวาสวัดพระธรรมกาย แต่จะเป็นผู้ควบคุมปกครองวัดพระธรรมกายเป็นที่ปรึกษา โดยให้พระวิเทศภาวนาจารย์ ทำหน้าที่รักษาการเจ้าอาวาสไปก่อน จนถึงวันที่ 5 ธันวาคมนี้
สำหรับกระแสข่าวว่าอาจจะเกิดความขัดแย้งภายใน หากพระภิกษุที่ถูกเลือกมาไม่เป็นที่ยอมรับของลูกศิษย์วัดพระธรรมกาย ทำให้เจ้าคณะจังหวัดปทุมธานี เจ้าคณะอำเภอคลองหลวง และเจ้าคณะตำบลคลองสี่ ต้องใช้ความละเอียดอ่อนอย่างมากในกระบวนการพิจารณาแต่งตั้ง ซึ่งจะต้องเสนอรายชื่อก่อนวันที่ 5 ธันวาคมนี้ เพราะรักษาการแทนเจ้าอาวาสจะหมดวาระการทำหน้าที่ แต่ถ้าไม่สามารถแต่งตั้งได้ เจ้าคณะจังหวัดปทุมธานีต้องมีเหตุผลมาอธิบายเพื่อความโปร่งใส
ด้านสำนักงานพระพุทธศาสนาแห่งชาติ จะเรียกประชุม 4 ฝ่าย ประกอบด้วย สำนักพุทธฯ กรมสอบสวนคดีพิเศษ วัดพระธรรมกาย และเจ้าคณะจังหวัดปทุมธานี เพื่อหารือกันอีกครั้งในประเด็นการเอาผิดถอดสมณเพศพระธัมมชโย รวมทั้งเรื่องการพิจารณาแต่งตั้งเจ้าอาวาสวัดพระธรรมกายคนใหม่ และการบริหารจัดการด้านวินัย ด้านคดีความ และทรัพย์สินวัดพระธรรมกาย ตามประกาศหัวหน้าคณะรักษาความสงบแห่งชาติ มาตรา 44 เรื่องพื้นที่ควบคุมพิเศษ ในวันที่ 31 มีนาคมนี้ เวลา 14.00 น. โดยคาดว่าหลังการประชุมเสร็จสิ้นน่าจะมีความชัดเจนมากยิ่งขึ้น