กรณีนี้ พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรี ชี้แจงเป็นข้อความผ่านแอพลิเคชั่นไลน์ ของ พล.ท.สรรเสริญ แก้วกำเนิด โฆษกประจำสำนักนายกรัฐมนตรี โดยเป็นข้อความเชิงออกมาขอโทษแทนตำรวจ ที่เข้าจับกุมนายสุวิทย์ ทองประเสริฐ หรือ อดีตพระพุทธะอิสระ โดยย้ำว่าการที่ตำรวจดำเนินการด้วยความรุนแรง ในเขตวัดหรือสังฆาวาส ไม่เหมาะสม เพราะทำให้กระทบกับความรู้สึกของประชาชน ยืนยันไม่ใช่เป็นการเข้าข้าง หรือ ความสัมพันธ์ส่วนตัว ตามที่ฝ่ายการเมืองวิพากษ์วิจารณ์
ข้อความส่วนหนึ่งระบุว่า “การกล่าวขอโทษของนายกฯ ไม่ได้เข้าข้างใคร แต่ขอโทษเพราะเจ้าหน้าที่ทำไม่เหมาะสม ไม่ว่าผู้ต้องหาจะเป็นใครก็ตาม เมื่อเข้าสู่กระบวนการยุติธรรมแล้วจะถูกตัดสินโดยศาล”
พล.อ.ประยุทธ์ ยืนยันว่ารัฐบาลปฏิบัติตามกฎหมายและพร้อมให้ความเป็นธรรมกับทุกฝ่าย และไม่ว่าผู้ต้องหาจะเป็นใคร เมื่อเข้าสู่กระบวนการยุติธรรม ก็ควรให้ศาลเป็นผู้ตัดสิน จึงไม่อยากให้สังคม วิพากษ์วิจารณ์บิดเบือนในเรื่องนี้