เชื้อราที่ผ่านการสกัด จะถูกฉีดเข้าไปที่ลำต้น และใบของผักตบชวา โดยฉีดซ้ำ2-3 รอบ ก่อนจะทิ้งไว้ 4 วัน จากนั้นผักตบชวาจะเริ่มเหี่ยวเฉาตาย ก่อนย่อยสลายไปตามธรรมชาติ เป็นวิธีที่อาจารย์และนักศึกษา สาขาวิชาชีวผลิตภัณฑ์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน ทดลองกับผักตบชวา ในแม่น้ำปิด ระยะทาง 500 เมตร วิธีนี้เป็นการกำจัดผักตบชวา ที่อาศัยกระบวนการทางธรรมชาติ ให้ผลอย่างยั่งยืน สอดคล้องกับนโยบายรัฐบาล ที่ต้องการกำจัดผักตบชวาที่ต้นทาง และช่วยลดต้นทุนภาครัฐ แต่ยังไม่ตอบโจทย์ เพราะผักตบมีเป็นจำนวนมาก
ดร.อาร์ม อันอาตม์งาม อ.สาขาชีวผลิตภัณฑ์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ กำแพงแสน กล่าวว่า เชื้อราที่ใช้กำจัดผักตบชวา ชื่อว่าโมโลติเชียม โลริดั้ม เป็นเชื้อราจากผักตบชวาสายพันธ์ต่างๆ ถูกคัดเฉพาะที่แข็งแรงที่สุด ก่อนนำไปเลี้ยงไว้กับข้าวเปลือก ในอุณหภูมิที่เหมาะสม เพาะให้เชื้อแข็งแรง ก่อนจะนำไปสกัด และฉีดที่ผักตบชวา การฉีดเชื้อรา ทำให้ผักตบชวาผิดปกติหรือเป็นโรค ไม่สามารถขยายพันธุ์ได้