อาคาร 100 ปี คุณยายจันทร์ ขนนกยูง มูลค่าการก่อนสร้างกว่า 5 พันล้านบาทบนที่ดิน 196 ไร่ของวัดพระธรรมกาย เป็นหนึ่งในทรัพย์สินจาก 1 หมื่น 3 พันล้านบาท ที่กรมสอบสวนคดีพิเศษสั่งยึดทรัพย์จากมูลนิธิมหารัตนอุบาสิกาจันทร์ ขนนกยูง หลังมีหลักฐานกรรมการ 2 คน ที่ดูแล มีส่วนเกี่ยวข้องกับการร่วมกันฟอกเงินคดีสหกรณ์เครดิตยูเนี่ย คลองจั่น
พ.ต.อ.ไพสิฐ วงศ์เมือง อธิบดีกรมสอบสวนคดีพิเศษ เผยว่า พนักงานสอบสวนคดีพิเศษมีมติสั่งยึดทรัพย์มูลค่ากว่า 1 หมื่น 3 พันล้านบาท ของมูลนิธิมหารัตนอุบาสิกาจันทร์ ขนนกยูง ฐานสมคบกันฟอกเงินและร่วมกันฟอกเงิน ตาม พ.ร.บ.ป้องกันและปราบปรามการฟอกเงิน 2542 และเสนอสั่งปิดมูลนิธิฯ เพราะพบความผิดปกติของเงินที่ได้มาและถูกนำมาใช้ผิดวัตถุประสงค์การเปิดมูลนิธิ โดยจะเสนอไปตามขั้นตอนคืออัยการและศาลต่อไป
สำหรับเส้นทางการเงินเข้ามูลนิธิมหารัตนอุบาสิกาจันทร์ ขนนกยูง จะเห็นว่าเงินไม่ได้ถูกบริจาคเข้ามาที่มูลนิธิฯโดยตรง แต่ถูกโอนมาจากบัญชีของพระธัมมชโย เพื่อนำมาสร้างอาคาร 100 ปี และสร้างมหารัตนวิหารคด และพบว่าเงินบางส่วนถูกนำไปเล่นหุ้นและซื้อที่ดินโดยพระในเครือข่ายวัดพระธรรมกาย ซึ่ง พ.ต.ท.ปกรณ์ สุชีวกุล ผอ.กองคดีการเงินการธนาคาร ระบุว่า การกระทำลักษณะจึงเป็นหลักฐานชัดเจนว่าเป็นการฟอกเงิน
สำหรับความคืบหน้าการติดตามตัวพระธัมมชโย มาดำเนินคดีข้อหาสมคบฟอกเงินหลังดีเอสไอยุติการค้นวัดหาตัวเมื่อวันที่ 10 มีนาคม 2560 อธิบดีกรมสอบสวนคดีพิเศษ เผยว่า อยู่ระหว่างการแกะรอยจากประวัติการรักษาตัว เส้นทางการเงิน และคนสนิท ผ่านมากว่า 1 ปี ยังไม่พบความเคลื่อนไหวทั้งในประเทศและต่างประเทศ